La présence des fonds de justice civile et pénale est à signaler.

Le bailliage d'Avallon, considéré comme bailliage particulier et second siège d'Auxois siégeant à Semur, avec une chancellerie unie, ressort au présidial de Semur et au parlement de Dijon. Il comprend dans son ressort la prévôté royale d'Avallon ; les châtellenies royales de Châtel-Gérard, Guillon et Montréal ; les marquisats de Ragny et Tanlay ; le comté de Chastellux ; les seigneuries du chapitre d'Avallon, de l'abbaye de Marcilly et de la commanderie de Pontaubert. En 1789, lors de la convocation des États-généraux, les paroisses suivantes dépendaient du bailliage d'Avallon : Angely, Annay-la-Côte, Annéot, Annoux, Anstrude, Athie, Avallon, Beauvilliers, Blacy, Bussières, Chastellux-sur-Cure, Châtel-Gérard, Cisery, Cussy-les-Forges, Domecy-sur-le-Vault, Étaules, Girolles, Guillon, Island, Magny, Marmeaux, Menades, Montréal, Pasilly, Pisy, Pontaubert, Quarré-les-Tombes, Saint-André-en-Terre-Plaine, Saint-Brancher, Sainte-Magnance, Saint-Germain-des-Champs, Santigny, Sarry, Sauvigny-le-Beuréal, Sauvigny-le-Bois, Savigny-en-Terre-Plaine, Sceaux, Sermizelles, Sincey-lès-Rouvray, Talcy, Tharoiseau, Tharot, Thisy, Thory, Trévilly, Vassy, Vault-de-Lugny, Vignes.

11 B 1-623 : documents entrés aux archives de l'Yonne lors des séquestres révolutionnaires et au cours du XIXe siècle.

B 4e supplément 74 ; B 5e supplément 86-87, 157 : documents identifiés lors de reclassements de fonds judiciaires, notariés ou d'archives communales déposées .

Dijon, archives départementales de Côte-d'Or. B II 120/1-B II/226 bis/1 : bailliage de Semur.