La sous-série 5 M regroupe des documents produits par la préfecture de l'Yonne dans le cadre de ses missions relatives à la santé publique et à l'hygiène.
On y trouve notament :
- des articles relatifs à la réglementation et à l'organisation des organismes consultatifs (conseil d'hygiène et de salubrité d'arrondissement, conseil départemental d'hygiène et commissions sanitaires) ainsi que des dossiers sur les délibérations et les procès-verbaux ;
- des documents concernant des prescriptions en matière d'hygiène et de salubrité publique qui permettent de résoudre les principaux problèmes de nuisances quotidiennes, notamment pour les communes (règlements sanitaires municipaux) ;
- des dossiers sur le personnel médical (listes nominatives), les sages-femmes, la pharmacie et plus particulièrement la police des officines (rapports concernant la surveillance des drogues et des médicaments) ;
- des statistiques sanitaires (enquêtes sur la mortalité dont la mortalité infantile) ;
- des dossiers sur différentes épidémies (grippe de 1837, tuberculose, variole et varicelle, maladies vénériennes...), et notamment le choléra : les épidémies de 1832 (registre des cas de décès), de 1848-1849, de 1854 (rapports des sous-préfectures, états nominatifs des victimes), de 1884 ; de même que des enquêtes sur le choléra de 1832 et de 1849 ;
- des articles portant sur la vaccine et la sérothérapie, des statistiques des vaccinations et sur la désinfection ;
- des documents portant sur l'hygiène et le contrôle alimentaire (service de la répréssion des fraudes), les vins d'appellation d'origine (règlementation, protection des appellations d'origine, relevés des déclarations de récoltes) ;
- des dossiers concernant la salubrité (déclarations et autorisations pour les machines à vapeur), ainsi que de nombreux dossiers relatifs aux établissements insalubres (tuilleries, fours à chaux...) : autorisation, puis déclarations.
